La ejecución de una carta arqueológica subacuática está encaminada a la localización, identificación y evaluación de los yacimientos arqueológicos sumergidos, valorando asimismo el riesgo al que están sometidos. Sólo así se puede obtener una información sobre la que establecer medidas de protección y diseñar estrategias de intervención.

En este marco, el Centro de Arqueología Subacuática optó desde el año 1997 por la realización de una carta arqueológica con el objetivo de contar con un catálogo de yacimientos que permita la tutela del patrimonio arqueológico subacuático de Andalucía desde el punto de vista de la protección, conservación e investigación. La información obtenida ha permitido a la Dirección General de Bienes Culturales la inscripción en el año 2009 de 56 Zonas Arqueológicas en el Catálogo General del Patrimonio Histórico Andaluz y la declaración de 42 Zonas de Servidumbre Arqueológica.